报告题目:一个快速算法和一个统计计分
报告人:刘湘涛博士,赛福解码(北京)基因科技有限公司技术总监,美国爱荷华大学COGA(酒精依赖遗传学研究)项目科学家
摘要:我们开发了一个快速算法用于求满足二阶常微分方程的函数的根,包括经典的特殊函数。这个方案是基于Prüfer变换和常微分方程解的泰勒级数展开的一个组合,计算复杂度是线性的O(n)。对于正则多项式,本方案也给出高斯积分的权重。数值实例证实了这个算法的优越性。我们定义了一个统计计分来检验全基因组关联研究(GWAS)中的本质相互作用。本质相互作用不同于可去相互作用,在任意单调变换下不会消失。利用边界条件的闭形式,我们可以高效的计算受约束的最大似然函数估计。整个计分框架被应用于6个GWAS研究。
报告人简介:刘湘涛博士,现任赛福解码(北京)基因科技有限公司技术总监,爱荷华大学Collaborative Studies of on Genetics of Alcoholism (COGA)项目科学家。1996-2003年就读于北京大学,获原子核物理学士及硕士。2004-2010年就读于耶鲁大学,获应用数学博士,先后师从美国科学院院士Vladimir Rokhlin,公共卫生学院Josephine Hoh与统计系Joseph Chang教授。2011-2014年5月先后在耶鲁大学精神科学系,俄亥俄州立大学James癌症中心与统计系任博士后,在Joel Gelernter,林诗丽与王前奔等教授的指导下研究精神科疾病与前列腺癌。2014年6月到2016年4月在爱荷华大学精神科系任研究科学家,跟韩士忠教授研究精神科疾病及物质依赖。2014年4月至今在COGA项目组研究各种表型。
刘湘涛博士是中美药协(SAPA)终身会员,美国统计学会和美国遗传学会会员。其研究领域包括生物信息学,统计遗传学,数学统计建模以及快速算法等等。他擅长第二代基因测序数据分析,全基因组关联分析以及连锁分析,集成分析和系统动力学。
报告时间:2017年3月24日(星期五)上午10:00点
报告地点:扬州大学数学科学学院38号楼一楼报告厅
主办单位:扬州大学数学科学学院